2016 yılının Ekim ayı sonunda Sarıçay`da nedeni belirlenemeyen toplu balık ölümleri yaşandı. Kamuoyu tarafından üzüntüyle karşılanan olay nedeniyle kafalarda soru işaretleri oluşmuş ve konunun araştırılması çeşitli çevrelerce talep edilmişti. İl Çevre ve Şehircilik Müdürlüğü ekipleri tarafından yapılan denetlemelerde, Sarıçay`a deşarjda bulunan kurumların numuneleri incelendi. Tek deşarj yapan kurumun Atık Su Tesisleri olduğu tespit edilirken, burada yapılan değerlendirmelerde anormal bir duruma rastlanmadı. Konu, İl Tarım Müdürlüğü`ne aktarıldı. Konunun üzerine düşen Çanakkale İl Gıda Tarım ve Hayvancılık Müdürlüğü`ne bağlı Balıkçılık ve Su Ürünleri Şube Müdürlüğü alanda topladığı numuneleri İstanbul`daki yetkili laboratuvara gönderdi. İstanbul`daki laboratuvarda yapılan deneylerde Sarıçay`ın içerisindeki; Biyokimyasal Oksijen İhtiyacı, Kimyasal Oksijen İhtiyacı, Askıda Katı Madde, Yağ ve Gres (Evsel Atıklardan), Yağ ve Gres (Endüstriyel Atıklardan), Fenoller, Serbest siyanür, Toplam Siyanürler, Serbest Klor, Toplam Sülfür, Nitrat Azotu, Toplam Fosfor, Amonyak Azotu, Florür, Civa, Kadmiyum, Kurşun, Arsenik, Krom, Bakır, Nikel, Çinko, pH değeri, Zehirlilik, Fekal koliform değerleri ölçüldü. Yapılan değerlendirmeler sonucunda anormal bir duruma rastlanmadı. Çevre ve Şehircilik Müdürlüğü yetkililerinden yapılan açıklamada su analizlerinin Devlet Su İşleri ekipleri tarafından yapıldığı belirtildi. Devlet Su İşleri yetkililerinden yapılan açıklamada ise kendilerinin konu ile ilgilenmediği, Çevre ve Şehircilik Müdürlüğü tarafından denetimlerin yapıldığı belirtildi. Devlet kurumları konuyu birbirlerine paslarken, Sarıçay`daki balık ölümlerinin nedeni henüz aydınlatılamadı.
